Lincoln University menawarkan berbagai program pascasarjana khusus, termasuk:
Master of Business (Keuangan)
Master of Business in Finance adalah kualifikasi pascasarjana tingkat lanjut untuk mahasiswa yang telah menyelesaikan gelar Sarjana. Lulusan Master of Business (Keuangan) akan mendapatkan perspektif tentang keuangan di Selandia Baru dan konteks internasional, dengan mengacu pada keberlanjutan, agribisnis, kewirausahaan, inovasi dan komersialisasi.
Master of International Rural Development
Master of International Rural Development (MRD) adalah program bersama antara Fakultas Agribisnis dan Perdagangan serta Fakultas Lingkungan, Masyarakat dan Desain. Program ini memberikan landasan kuat dalam konsep dan teori pengembangan pedesaan internasional, dan melengkapi lulusan dengan keterampilan analitis dan praktis yang mereka perlukan untuk terlibat secara kritis dalam kegiatan pembangunan dan perdebatan dari perspektif interdisipliner.
Master of Planning
Master of Planning dirancang untuk memenuhi persyaratan dari New Zealand Planning Institute (NZPI) dan memiliki penekanan pada konteks perencanaan Selandia Baru. Para lulusan memenuhi syarat untuk mendapatkan Keanggotaan Pascasarjana dari NZPI, yang memiliki kelebihan jika mereka mencari pekerjaan di Inggris, Irlandia dan Australia, serta Selandia Baru.
Master of Science dalam Inovasi Makanan
Master of Science dalam Inovasi Makanan adalah gelar master (180-kredit) satu tahun yang bertujuan menciptakan para ilmuwan makanan terkemuka di dunia. Para mahasiswa fokus pada komposisi makanan, kualitas, pengolahan, inovasi, pemasaran dan nutrisi manusia.
Master of Sport and Recreation Management
Master of Sport and Recreation Management memberikan pemahaman tentang kompleksitas sektor olahraga dan rekreasi, dan bagaimana dimensi pemerintahan, ekonomi, hubungan sosial dan lingkungan di skala lokal, nasional dan global dapat mempengaruhi keputusan bisnis individu dan perencanaan jangka panjang dalam sektor ini.